Одним из главных недостатков планшета HTC Flyer считалась пусть и существенно модифицированная, но все же устаревшая и изначально не оптимизированная под планшеты операционная система Android 2.x. После релиза Honeycomb встал вопрос об обновлении ОС и владельцам Flyer была обещана новая версия Android. По всей видимости, адаптация работы устройства под планшетное ПО отняла у разработчиков больше времени, чем предполагалось ранее и апдейт вышел только сейчас.
Первыми опробовать новую операционную систему на своих устройствах смогли владельцы Flyer во Франции и Нидерландах, именно с этих стран HTC решила начать распространение обновления.
Сообщается, что поставляется апдейт по методу OTA, а объем загружаемых данных достаточно внушительный и равен 210 Мбайт. На данный момент известно, что обновляются устройства с поддержкой WiFi и 3G и объемом интегрированной памяти 32 Гбайт, тогда как данных по обновлению младшей WiFi-модификации Flyer пока нет. После установки версия операционной системы Android изменяется на 3.55.405.1.